Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM43Q9BTV4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms