Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP1Q9BPW8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms