Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPAS2Q99743 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms