Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms