Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEPDC7Q96QD5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms