Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD4Q96M96 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms