Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms