Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BICD1Q96G01 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms