Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms