Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF183Q96D59 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF183Q96D59 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF183Q96D59 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF183Q96D59 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms