Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms