Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM20Q8N5G0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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