Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00518Q8N0U6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms