Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMC4Q7Z404 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms