Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST3Q7LGC8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms