Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCD1Q6ZMY3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCD1Q6ZMY3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCD1Q6ZMY3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCD1Q6ZMY3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCD1Q6ZMY3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms