Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms