Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH4AQ5TD94 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms