Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PERM1Q5SV97 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms