Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYTL3Q4VX76 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYTL3Q4VX76 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYTL3Q4VX76 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYTL3Q4VX76 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYTL3Q4VX76 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYTL3Q4VX76 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYTL3Q4VX76 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYTL3Q4VX76 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms