Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY2Q49AN0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms