Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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