Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCEA2Q15560 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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