Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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