Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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