Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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