Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H3Q13889 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms