Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2DQ13557 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2DQ13557 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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