Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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