Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FOXE3Q13461 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXE3Q13461 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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