Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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