Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RESTQ13127 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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RESTQ13127 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RESTQ13127 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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RESTQ13127 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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RESTQ13127 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RESTQ13127 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RESTQ13127 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RESTQ13127 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RESTQ13127 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RESTQ13127 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RESTQ13127 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RESTQ13127 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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