Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRDM2Q13029 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
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