Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms