Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCDQ05655 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms