Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms