Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms