Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU5F1Q01860 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU5F1Q01860 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms