Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2MP61081 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms