Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR4P61073 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms