Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTBP60709 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTBP60709 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms