Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAG2P55895 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAG2P55895 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAG2P55895 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAG2P55895 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAG2P55895 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAG2P55895 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAG2P55895 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAG2P55895 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAG2P55895 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAG2P55895 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAG2P55895 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAG2P55895 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAG2P55895 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAG2P55895 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms