Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC3P51654 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC3P51654 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC3P51654 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms