Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms