Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCLMP48507 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCLMP48507 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCLMP48507 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCLMP48507 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCLMP48507 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCLMP48507 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCLMP48507 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms