Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD13P35453 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms