Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMBRP28336 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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