Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4BPBP20851 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms