Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP4AP20648 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms