Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms